Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 GBP4-201ENST00000355754 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 DGKK-201ENST00000611977 7407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 PPFIA2-220ENST00000550584 5405 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
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LRRIQ1Q96JM4 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
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LRRIQ1Q96JM4 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
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LRRIQ1Q96JM4 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
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LRRIQ1Q96JM4 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
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LRRIQ1Q96JM4 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
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LRRIQ1Q96JM4 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 TNC-202ENST00000350763 7641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
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LRRIQ1Q96JM4 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
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LRRIQ1Q96JM4 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC105342.1-201ENST00000378334 6848 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 GRIP1-201ENST00000359742 5216 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 SGMS2-202ENST00000394684 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
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