Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 MIR128-2-201ENST00000384893 84 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC092066.1-201ENST00000425131 317 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC104958.1-201ENST00000509350 1973 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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