Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
AP5B1Q2VPB7 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms