Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ASPH-204ENST00000389204 1290 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 SETP22-201ENST00000412243 957 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC009269.1-203ENST00000496414 828 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC097460.2-201ENST00000511857 741 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 KDM5DP1-201ENST00000622542 298 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 FHL5-203ENST00000541107 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RNA5SP427-201ENST00000365323 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC003087.1-201ENST00000412828 499 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 PHBP4-201ENST00000437447 837 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 CR391992.1-201ENST00000438601 394 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 SLC8A1-AS1-207ENST00000444629 935 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC092421.1-201ENST00000448148 418 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC083967.1-201ENST00000522354 515 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL355102.4-201ENST00000553638 738 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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