Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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