Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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FOXF1Q12946 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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FOXF1Q12946 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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FOXF1Q12946 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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