Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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