Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 OR51H1-201ENST00000322059 999 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 FCAR-204ENST00000359272 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 C1D-203ENST00000409302 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL591846.2-201ENST00000425161 358 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RPSAP62-201ENST00000432596 833 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC016396.1-201ENST00000440189 328 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 STARD13-IT1-201ENST00000456087 452 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RPL34P22-201ENST00000468193 318 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 OR4A1P-201ENST00000532342 920 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LINC00678-202ENST00000534757 798 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC067735.1-201ENST00000551152 526 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LINC00640-201ENST00000554409 498 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 CMC2-213ENST00000565914 528 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MIR5705-201ENST00000579870 89 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 CCL4L2-212ENST00000615418 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 CCNT1-206ENST00000640148 596 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL354719.2-201ENST00000429530 1454 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL157713.1-201ENST00000379752 1531 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PAGE4-201ENST00000218068 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms