Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 VMA21-201ENST00000330374 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 C11orf88-203ENST00000529167 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
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PTPRAP18433 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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PTPRAP18433 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
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PTPRAP18433 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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PTPRAP18433 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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PTPRAP18433 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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PTPRAP18433 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
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