Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms