Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMP3Q9NV31 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms