Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 GPR1-203ENST00000437420 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 PIP-201ENST00000291009 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 SNORD15A-201ENST00000384214 148 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL161646.1-201ENST00000447860 1013 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 FGF12-AS3-201ENST00000452848 291 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC00881-201ENST00000467995 589 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 GRHL1-206ENST00000480736 572 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC01085-203ENST00000511195 326 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC117383.2-201ENST00000514722 322 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC083843.1-201ENST00000521444 849 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 OR7E94P-202ENST00000601375 790 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 CUX2P1-201ENST00000606426 298 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC125232.1-201ENST00000452554 1408 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RBMX2P2-201ENST00000257020 946 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 EEF1A1P34-201ENST00000419888 1267 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC092162.2-203ENST00000430460 579 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC00578-202ENST00000442937 612 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL451074.4-201ENST00000447545 470 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC108868.2-201ENST00000451464 511 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC00652-202ENST00000454749 963 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RN7SL58P-201ENST00000473445 294 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms