Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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CLDN19Q8N6F1 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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CLDN19Q8N6F1 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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CLDN19Q8N6F1 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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