Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 HHLA3-203ENST00000370940 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL606804.1-202ENST00000446347 481 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RN7SL213P-201ENST00000463482 317 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RN7SL520P-201ENST00000474110 286 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC092336.1-201ENST00000510562 415 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RNA5SP422-201ENST00000516778 111 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC023078.5-201ENST00000528646 707 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC091180.5-201ENST00000576461 382 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 BOLA2P1-201ENST00000584794 232 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 Metazoa_SRP.42-201ENST00000621081 348 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 B4GALT6-203ENST00000383131 1239 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 STSP1-201ENST00000412493 1151 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RPSAP59-201ENST00000421048 890 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC092568.1-201ENST00000440950 1284 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms