Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC119674.1-201ENST00000641611 1210 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139 ms