Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ZNF182-202ENST00000396965 3586 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 LINC01638-202ENST00000444114 637 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 CCDC60-204ENST00000539847 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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