Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 SSX6-201ENST00000376932 562 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
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NCOA4Q13772 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 GRXCR1-201ENST00000399770 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
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NCOA4Q13772 RN7SL815P-201ENST00000470970 290 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC139769.1-201ENST00000471224 1001 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
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NCOA4Q13772 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 CLEC4E-206ENST00000545274 730 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
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NCOA4Q13772 MAPK10-333ENST00000641607 2481 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NCOA4Q13772 ZSCAN9-207ENST00000531979 1601 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
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NCOA4Q13772 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
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NCOA4Q13772 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
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NCOA4Q13772 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
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NCOA4Q13772 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NCOA4Q13772 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NCOA4Q13772 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NCOA4Q13772 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
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