Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC112203.1-201ENST00000506315 1020 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LINC02389-202ENST00000540024 557 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 CRTC3-AS1-201ENST00000558105 502 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LINC00906-202ENST00000587998 648 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ELMO2P1-201ENST00000611569 473 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 PART1_3.1-201ENST00000619680 131 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 YME1L1-201ENST00000326799 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 TRIM49-202ENST00000532501 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 SLC17A2-202ENST00000360488 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 FCGR2A-202ENST00000367972 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 IGSF22-205ENST00000513874 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 CEACAMP3-201ENST00000473762 1548 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 DYNLT1-202ENST00000367088 2891 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC009148.1-201ENST00000570148 2693 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ATP1A2-202ENST00000392233 3338 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 FAM107A-202ENST00000394481 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 CCPG1-212ENST00000569205 2970 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ERG-206ENST00000398911 4914 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 DHRS9-201ENST00000357546 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LINC00683-202ENST00000579781 3510 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 GNE-205ENST00000539815 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 CBFA2T2-209ENST00000492345 7803 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RPL7-203ENST00000396466 762 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 PKMP3-201ENST00000405497 715 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC098828.1-201ENST00000436164 440 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL161937.1-202ENST00000451960 341 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL135908.1-202ENST00000454135 562 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RN7SL145P-201ENST00000469955 296 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 CCL26-201ENST00000005180 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC009779.4-201ENST00000554248 611 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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