Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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