Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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FOXF1Q12946 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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FOXF1Q12946 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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