Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 LINC00518-202ENST00000479822 906 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 RPL12P1-201ENST00000374520 498 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 OSTN-AS1-201ENST00000430375 515 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 CDK7P1-201ENST00000434574 693 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AC105999.2-203ENST00000521030 663 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AC079866.1-201ENST00000534985 1220 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DEFA6Q01524 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms