Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RBM22-201ENST00000199814 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 KY-201ENST00000423778 2345 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 SERPINA9-203ENST00000380365 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 KLHL3-207ENST00000506491 6566 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 TTC8-206ENST00000380656 2171 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RPL28-201ENST00000344063 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 PTCH1-203ENST00000375274 4720 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 DDX19A-201ENST00000302243 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 SPRR2D-204ENST00000368758 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL031777.1-201ENST00000405418 499 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC064874.1-201ENST00000409661 441 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CCNT2-AS1-203ENST00000428857 677 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC092803.1-201ENST00000439570 359 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RN7SL864P-201ENST00000493457 285 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RPL7AP2-201ENST00000496515 740 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC091939.1-201ENST00000522704 691 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 PCED1B-AS1-206ENST00000550426 683 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC034102.1-201ENST00000552016 604 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 PCED1B-AS1-211ENST00000552990 654 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC005303.1-201ENST00000607906 740 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RN7SL185P-201ENST00000615150 249 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RN7SL673P-201ENST00000616262 237 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RN7SL495P-201ENST00000616925 237 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RN7SL719P-201ENST00000620196 237 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RN7SL469P-201ENST00000621501 237 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CSPG4P4Y-201ENST00000333235 3724 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CSPG4P3Y-201ENST00000418188 3724 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MIR646HG-207ENST00000432910 2043 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LEMD1-AS1-201ENST00000447832 2781 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ZNF226-215ENST00000590089 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CHRNA2-202ENST00000407991 4067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RIMS2-202ENST00000339750 3780 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 BEND3-201ENST00000369042 6200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 C8orf34-201ENST00000325233 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 NRP1-212ENST00000432372 4137 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AP5S1-205ENST00000615891 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 BARD1-210ENST00000613374 4096 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 USP14-202ENST00000383589 2168 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 TRPV3-211ENST00000616411 5742 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LINC01777-201ENST00000423197 2077 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CAMSAP1-201ENST00000312405 6054 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 NXPE1-205ENST00000536312 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 NUP85-211ENST00000579324 2010 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AP001120.1-201ENST00000561598 3710 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CCDC144NL-AS1-207ENST00000577537 3727 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LY86-AS1-201ENST00000429345 1941 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CHEK1-213ENST00000532449 4051 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CNTRL-212ENST00000613863 2418 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL513220.1-201ENST00000641190 1326 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MTIF2-204ENST00000403721 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LINC01484-203ENST00000521128 2361 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 PRNT-201ENST00000326539 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RPS11-201ENST00000270625 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RPS12P16-201ENST00000399739 407 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 TSPAN9-202ENST00000407263 956 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC079834.1-201ENST00000414016 421 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ZNF70P1-201ENST00000417480 624 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL645998.1-201ENST00000424552 345 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC239860.1-201ENST00000444680 1270 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RN7SL338P-201ENST00000481467 293 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RPL34P29-201ENST00000491411 325 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RN7SL445P-201ENST00000495609 293 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 SNCA-AS1-202ENST00000513653 801 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC120042.1-201ENST00000524309 550 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 C1RL-211ENST00000545280 449 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ULK4P3-202ENST00000565158 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MIR4663-201ENST00000582039 76 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC008870.5-201ENST00000624143 650 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 OLMALINC-206ENST00000641799 1195 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CABYR-206ENST00000463087 1792 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ANO3-201ENST00000256737 6642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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