Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CASP1P29466 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CASP1P29466 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CASP1P29466 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CASP1P29466 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CASP1P29466 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CASP1P29466 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CASP1P29466 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CASP1P29466 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CASP1P29466 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASP1P29466 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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CASP1P29466 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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CASP1P29466 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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CASP1P29466 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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CASP1P29466 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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CASP1P29466 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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CASP1P29466 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CASP1P29466 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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