Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 GPR19-201ENST00000332427 1743 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OR2AK2-201ENST00000366480 1154 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 HIST1H2BPS2-201ENST00000402707 340 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RPSAP42-201ENST00000403415 878 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RPL6P2-201ENST00000425480 783 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PRSS48-201ENST00000441586 560 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TTC21B-AS1-202ENST00000443032 544 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RPL22L1-202ENST00000463836 506 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MRPL49P1-201ENST00000505951 535 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC006070.1-201ENST00000508151 193 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OR10J9P-201ENST00000511932 987 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC02223-203ENST00000514771 781 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CCNC-215ENST00000523799 1035 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC025252.2-201ENST00000537470 502 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PPIAL4D-201ENST00000544708 495 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL355076.3-201ENST00000555838 587 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC103740.1-204ENST00000557994 570 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC012181.2-201ENST00000570210 699 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC136944.5-201ENST00000573021 151 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC091180.5-201ENST00000576461 382 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC010761.6-201ENST00000587898 197 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC079456.1-201ENST00000624010 480 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms