Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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PTPRCP08575 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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PTPRCP08575 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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PTPRCP08575 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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PTPRCP08575 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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PTPRCP08575 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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PTPRCP08575 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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PTPRCP08575 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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PTPRCP08575 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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PTPRCP08575 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 LINC02250-201ENST00000422117 2491 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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