Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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FANCFQ9NPI8 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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FANCFQ9NPI8 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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