Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CEP44Q9C0F1 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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CEP44Q9C0F1 AL162171.3-201ENST00000617439 3178 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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CEP44Q9C0F1 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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CEP44Q9C0F1 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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