Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 TXNDC9-202ENST00000409434 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 RTCA-AS1-201ENST00000421185 423 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 FAM155A-IT1-201ENST00000449551 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 NDUFB4P1-201ENST00000462398 381 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC005495.1-201ENST00000586611 1211 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 TMEM55A-206ENST00000630164 171 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 NDFIP2-206ENST00000620924 2324 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC023886.2-201ENST00000321285 411 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 NUDT5-202ENST00000378937 919 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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