Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FSCN1Q16658 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms