Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NTRK2Q16620 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms