Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 CU638689.4-205ENST00000623313 596 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 SERPINB13-202ENST00000344731 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 MLIP-201ENST00000274897 1815 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 FLJ21408-201ENST00000499939 2594 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC104066.2-201ENST00000564513 1741 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 ZNF812P-202ENST00000536819 1890 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RPL7L1P11-201ENST00000446092 721 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 CCDC60-204ENST00000539847 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 GRIA4-206ENST00000525187 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 CNPY1-204ENST00000636446 1637 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 JAZF1-201ENST00000283928 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms