Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 FAM135B-204ENST00000395297 6962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 TRPM3-204ENST00000360823 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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