Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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