Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 RPL7L1P11-201ENST00000446092 721 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AL513548.2-201ENST00000602994 1207 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 OR7A1P-201ENST00000601206 970 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SPTBN1Q01082 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms