Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms