Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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CCDC88CQ9P219 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC88CQ9P219 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
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CCDC88CQ9P219 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
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CCDC88CQ9P219 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
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CCDC88CQ9P219 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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CCDC88CQ9P219 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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CCDC88CQ9P219 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC88CQ9P219 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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