Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
DMRT3Q9NQL9 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms