Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 ZFP42-203ENST00000618147 2338 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 GDNF-208ENST00000620847 3638 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 C11orf88-203ENST00000529167 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 PPP2R5C-218ENST00000556260 2013 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 ASAH1-203ENST00000381733 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 IKZF3-203ENST00000346872 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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