Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 CSF3R-203ENST00000373103 3454 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 ZNF655-213ENST00000425063 4624 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 NR1I3-203ENST00000367981 1076 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 GAPDHP32-201ENST00000433816 998 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 LINC01015-204ENST00000445296 399 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AL590490.1-201ENST00000455599 316 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC080188.1-201ENST00000491923 567 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 NR1I3-226ENST00000508740 977 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC090287.1-201ENST00000578374 291 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC135050.6-202ENST00000613584 392 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 STRADA-246ENST00000640397 1045 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 SS18-203ENST00000415083 3414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 NAIP-204ENST00000503719 5347 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 FZD6-201ENST00000358755 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 TENM2-203ENST00000518659 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 LINC01140-201ENST00000461990 3181 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC008467.1-201ENST00000512693 5471 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 L3MBTL3-203ENST00000368139 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 ANO2-201ENST00000327087 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 LARP1B-210ENST00000512292 3105 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 TBC1D22A-AS1-202ENST00000640274 1951 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AL662907.2-201ENST00000624339 3448 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 CCDC191-201ENST00000295878 3976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 FAM171A1-201ENST00000378116 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 NLRP3-204ENST00000366497 4318 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 MAGEB16-205ENST00000399992 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AJUBA-203ENST00000397388 2648 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 ELF4-204ENST00000615377 3878 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 TYW1-201ENST00000359626 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 BBS9-203ENST00000355070 4004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 THAP12P1-201ENST00000398672 2203 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 CALD1-201ENST00000361675 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 C1orf87-201ENST00000371201 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 TRAPPC2-201ENST00000359680 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AL450992.1-201ENST00000432386 4109 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 PIEZO2-203ENST00000503781 8259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 CELF1-205ENST00000395292 2191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 DET1-202ENST00000444300 2154 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 STAG3-219ENST00000620100 4203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC021054.1-201ENST00000537514 2338 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 HINFP-201ENST00000350777 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 FAM13C-217ENST00000618804 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AL353151.1-201ENST00000402406 604 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.1 ms