Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 NR1I3-202ENST00000367980 1403 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ACKR2-201ENST00000422265 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 TAS2R2P-201ENST00000421146 910 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 LINC01049-201ENST00000426840 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC226119.1-201ENST00000514073 682 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 SLC30A8-208ENST00000521243 1393 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 EEF1A1P22-201ENST00000559385 1380 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC022405.1-201ENST00000559841 516 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC010333.1-201ENST00000563116 563 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 HYKK-205ENST00000566332 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RN7SL835P-201ENST00000579920 262 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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