Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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BRD3Q15059 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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BRD3Q15059 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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BRD3Q15059 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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BRD3Q15059 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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BRD3Q15059 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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BRD3Q15059 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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BRD3Q15059 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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BRD3Q15059 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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BRD3Q15059 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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BRD3Q15059 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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BRD3Q15059 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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