Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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