Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
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TCIRG1Q13488 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
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TCIRG1Q13488 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
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TCIRG1Q13488 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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TCIRG1Q13488 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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TCIRG1Q13488 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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TCIRG1Q13488 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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TCIRG1Q13488 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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TCIRG1Q13488 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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TCIRG1Q13488 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
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