Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 VWA5A-204ENST00000449321 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 CNIH4-202ENST00000366857 3963 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 NDUFS1-202ENST00000423725 2631 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 SAR1A-205ENST00000373242 5981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RPS27-202ENST00000392558 625 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RNA5SP29-201ENST00000410988 106 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 MDC1-AS1-201ENST00000442150 738 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC064862.2-201ENST00000445460 196 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 NDUFA5P3-201ENST00000449348 345 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL357874.2-201ENST00000457044 679 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 SEM1-210ENST00000488005 775 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC114744.1-201ENST00000498116 666 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC093281.1-201ENST00000514239 549 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 ASPH-225ENST00000522835 1258 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC090115.1-201ENST00000548257 562 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 LINC02137-201ENST00000561906 644 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 YARS-210ENST00000616261 1167 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 LINC01002-228ENST00000633402 565 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC009971.1-201ENST00000634253 673 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 CCDC136-201ENST00000297788 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 MROH5-201ENST00000430863 4164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 ETV1-206ENST00000405218 3391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 UVSSA-202ENST00000389851 12605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 MYO7B-201ENST00000409090 3567 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 TMEM45B-202ENST00000524567 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 VWA3B-213ENST00000477737 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 EMC3-201ENST00000245046 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 UNC79-205ENST00000555664 8484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 ADGRG1-255ENST00000567835 3741 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 OSBPL6-204ENST00000359685 7114 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL021937.1-201ENST00000420171 1558 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 ATXN1L-201ENST00000427980 7886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 SMAP2-206ENST00000614549 2570 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 MAT2A-201ENST00000306434 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RTL1-201ENST00000534062 4193 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 SZRD1-202ENST00000401089 3447 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RAD51B-211ENST00000487861 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 ABCC11-202ENST00000356608 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 U91328.2-201ENST00000606723 4130 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 TFCP2L1-201ENST00000263707 9292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 FN1-209ENST00000432072 7759 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 TTC3-202ENST00000355666 7712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 OR10G7-201ENST00000330487 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 S100A8-201ENST00000368732 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RPL21P107-201ENST00000411449 460 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RPL7AP72-201ENST00000417266 768 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC091808.1-201ENST00000438867 786 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL441992.1-201ENST00000443631 544 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RPL12P5-201ENST00000475149 392 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 ACTG1P20-201ENST00000486001 468 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RPL10AP1-201ENST00000490023 643 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC023403.1-202ENST00000521139 759 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 IGKV3-34-201ENST00000521692 293 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 TDGF1P5-201ENST00000523009 453 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms