Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC009237.9-201ENST00000414800 347 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RPL5P6-201ENST00000425640 886 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC243962.1-201ENST00000441512 579 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 FANK1-AS1-201ENST00000445458 428 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC239798.1-201ENST00000449024 1176 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC097263.1-201ENST00000496795 606 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RPL22-208ENST00000497965 786 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC026700.1-201ENST00000512074 544 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC02365-203ENST00000522554 802 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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CLN3Q13286 AP003721.1-201ENST00000543907 864 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 THAP2-202ENST00000547843 672 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC067735.1-201ENST00000551152 526 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC01397-201ENST00000554808 579 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 EIF4EBP2P2-201ENST00000563883 333 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC027796.5-201ENST00000573568 560 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RN7SL154P-201ENST00000578043 324 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC01198-208ENST00000599175 560 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC010385.2-201ENST00000603743 490 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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CLN3Q13286 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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CLN3Q13286 MLANA-203ENST00000381477 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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CLN3Q13286 PSG9-205ENST00000443718 1421 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 C12orf77-202ENST00000549262 1443 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 NAT10-210ENST00000615292 3329 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 WDPCP-206ENST00000409562 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 TPD52-202ENST00000379097 2563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 TPD52-204ENST00000517427 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LDB3-201ENST00000263066 3873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 TRIO-201ENST00000344135 4065 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ARID5B-202ENST00000309334 3141 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MAATS1-201ENST00000273390 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 OR2A1-202ENST00000641044 4632 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC091940.1-204ENST00000507318 3091 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 GLYAT-202ENST00000344743 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CCDC149-204ENST00000504487 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ABRAXAS1-201ENST00000321945 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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