Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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PGGT1BP53609 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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