Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 RN7SL628P-201ENST00000619139 237 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 FBXO36-201ENST00000283946 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 UGT2B28-201ENST00000335568 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 PROM1-210ENST00000510224 4006 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 CLRN1-AS1-202ENST00000476886 2223 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 CNOT4-207ENST00000451834 3507 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 CNTN4-201ENST00000397459 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 VWA5A-205ENST00000456829 4388 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 GNG12-201ENST00000370982 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
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PTPREP23469 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
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PTPREP23469 C7-201ENST00000313164 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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PTPREP23469 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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PTPREP23469 KIF23-203ENST00000395392 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
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PTPREP23469 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AL022721.1-201ENST00000436521 505 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AL606534.2-201ENST00000436756 624 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PTPREP23469 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PTPREP23469 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
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