Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ODC1P11926 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ODC1P11926 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ODC1P11926 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ODC1P11926 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ODC1P11926 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ODC1P11926 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ODC1P11926 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ODC1P11926 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ODC1P11926 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ODC1P11926 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ODC1P11926 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms