Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCN2BO60939 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms