Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 DPH5-211ENST00000488176 1034 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LINC01653-201ENST00000456026 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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HOXA3O43365 UAP1-203ENST00000367925 2069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 TRIM64EP-201ENST00000531233 1307 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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HOXA3O43365 LINC02347-201ENST00000397346 2458 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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HOXA3O43365 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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